با کسب مجوز پذیرش دانشجو در مقطع کارشناسی ارشد  رشته روان شناسی اسلامی از مهر ماه 94، تعداد رشته های دانشگاه پیام نور مرکز گناباد به پنج رشته ارتقاء یافت. هم اکنون رشته های موجود در دانشگاه پیام نور مرکز گناباد در مقطع کارشناسی ارشد شامل : 1 _ علوم تربیتی گرایش تحقیقات آموزشی 2 _ ریاضی کاربردی گرایش تحقیق در عملیات 3 _ شیمی گرایش شیمی معدنی 4 _ زبان و ادبیات فارسی 5 _ روان شناسی اسلامی میباشد.